Beta-Lactamase DataBase (BLDB): Structure and Function
Beta-Lactamase DataBase
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Beta-Lactamase DataBase

Sequence alignment for the CTX-M beta-lactamase family

CTX-M-1
........10........20........30........40........50........60........70........80........90.......100.......110.......120.......130.......140.......150.......160.......170.......180.......190.......200.......210.......220.......230.......240.......250.......260.......270.......280.......290.......300.......310...
---MVKKSLRQFT-LMAT-------ATVTLLLGSVPLYAQTADVQQKLAELERQSGGRLGVALINTADNSQILYRADERFAMCSTSKVMAVAAVLKKSESEPNLLNQRVEIKKSDLVNYNPIAEKHVDGTMSLAELSAAALQYSDNVAMNKLISHVGGPASVTAFARQLGDETFRLDRTEPTLNTAIPGDPRDTTSPRAMAQTLRNL------TLGKALGDSQRAQLVTWMKGNTTGAASIQAGLPASWVVGDKTGSGDYGTTNDIAVIWPKDRAPLILVTYFTQPQPKAESRRDVLASAAKIVTNGL-----
CTX-M-2---.MTQ.I.RSM-.TVM-------..LP..FS.AT.H..ANS...Q.EA..KS....................................A.....Q...DKH........................N...T....G.........T......A.L...DK......S...........................T.L......K..------......AET........L......S...R....K........................ENH...V........EQ.......I..A......H.F----- 79.73 %
CTX-M-3---..........-....-------.................................................................A....................................N.........................A.....................................................------............................................................................................D..----- 98.63 %
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CTX-M-5---.MTQ.I.RSM-.TVM-------..LP..FS.AT.H...NS...Q.EA..KS....................................A.....Q...DKH........................N...T....G.........T......A.L...DK......S...........................T.L......K..------......AET........L......S...R....K..G.....................ANH...V........EQ..........A......H.F----- 80.07 %
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CTX-M-7---.MTQ.I.RSM-.TVM-------..LP..FS.AT.H..ANS...Q.EA..KS....................V...............A.....Q...DKH........RA..............N...T..Q.G.G.......T......A.L...DK......S................S..........T.L......K..------......AET........L......S...R....K..G.....................ENH...V........EQ..........A......H.F----- 77.66 %
CTX-M-8---.MRHRVKRMM-..T.-------.CIS.....A.....AN.......A..KS..........D....A.T..................A.....Q..TQKKV.S.K....S...I.....T....N...T..............T......A.L...DK......AI..N.......................T.L.........------...S...ET........L...............T........................EG.............EQ..........A......D.Y----- 80.07 %
CTX-M-9---..T.RVQRMM-FA.A-------.CIP.....A......SA......A..KS..........D....T.V...G....P.........A.....Q..TQKQ....P....PA.............N...T..............T......AQL...GG......AI..........................T.........Q.------...H...ET........L..........R....T..TA....................QG....V.........QN............R.IAE..----- 78.69 %
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CTX-M-25---.MR..V.RAM-..T.-------.C.S...A....C..AN.......A..KS...............T.T........................Q..TQKG..S......P...I..........N...TFG............T......A.L...DK......TI..D.......................T.L....A....------...N....T......M.L...............T...........G............EG....V.......SE...........A..R...D.Y----- 80.76 %
CTX-M-26---.MR..V.RAM-..T.-------.C.S...A....C..AN.......A..KS...............T.T..................A.....Q..TQKG..S......P...I..........N...TFG............T......A.L...DK......TI..D.......................T.L....A....------...N....T......M.L..........R....T........................EG....V.......SE...........A..R...D.Y----- 80.41 %
CTX-M-27---..T.RVQRMM-FA.A-------.CIP.....A......SA......A..KS..........D....T.V...G....P.........A.....Q..TQKQ....P....PA.............N...T..............T......AQL...GG......AI..........................T.........Q.------...H...ET........L..........R....T..T........G............QG....V.........QN............R.IAE..----- 78.69 %
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CTX-M-43---.MTQ.I.RSM-.TVM-------..LP..FS.AT.H..ANS...Q.EA..KS....................................A.....Q...DKH........................N...T....G.........T......A.L...DK......S...........................T.L......K..------......AET........L......S...R....K...........G............ENH...V........EQ...R...I..A......H.F----- 79.04 %
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CTX-M-87---..T.RVQRMM-FA.A-------.CIP.....A......SA......A..KS..........D....T.V...G....P...............Q..TQKQ....P....PA.............N...T..............T......AQL...GG......AI...........L..............T.........Q.------...H...ET........L..........R....T..T.....................QG....V.........QN............R.IAE..----- 79.04 %
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A-CTX-M phylogenetic tree

Last updated: April 06, 2026.

If you use BLDB please cite: Naas, T.; Oueslati, S.; Bonnin, R. A.; Dabos, M. L.; Zavala, A.; Dortet, L.; Retailleau, P.; Iorga, B. I., Beta-Lactamase DataBase (BLDB) – Structure and Function. J. Enzyme Inhib. Med. Chem. 2017, 32, 917-919.

The development of the BLDB database was funded in part by the JPIAMR transnational project DesInMBL, the Région Ile-de-France (DIM Malinf) and the Laboratory of Excellence in Research on Medication and Innovative Therapeutics (LERMIT).

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